Virologie

Il assure les activités de dépistage VIH, hépatites B et C, le diagnostic des autres hépatites virales (hépatites A et E) et rétrovirus (HTLVI/II), le diagnostic des infections aux Herpesviridae (herpès, varicelle, EBV, CMV), et des infections dues aux virus de la rubéole, rougeole, parvovirus B19, oreillons et des arboviroses.
L’exploration de la réponse humorale post-infection ou post-vaccination COVID a été mise en place au laboratoire en 2020. 
Ce secteur participe à la surveillance séro-épidémiologique nationale de certaines infections virales (en dehors des maladies à déclaration obligatoire).

La majorité des sérologies sont réalisées par immuno-analyse en chimioluminescence ou ELISA par analyses automatisées sur la plateforme de Biochimie Immuno Analyse (BIA) située au rez de chaussée du bâtiment. Des techniques plus spécialisées semi automatisées ou manuelles (ex western-blot HIV-1/2, avidité CMV, immunofluorescence,agglutination, séroneutralisation sont effectuées au 3e étage.

Ilutilise des techniques de PCR monoplexes ou multiplexes et des techniques de séquençage moléculaire de type « Sanger » ou dites de « nouvelle génération » (NGS Next Generation Sequencing). La combinaison de ces techniques permet de :

• Diagnostiquer les infections virales aiguës ou chroniques (SARS-CoV-2, grippe, VRS, rotavirus, norovirus, sapovirus, Hépatite E, arboviroses, herpesviroses, HPV…) 
• Quantifier les charges virales dans certaines infections (VIH, hépatites B et C, herpesviroses) 
• De détecter par séquençage moléculaire des résistances aux antiviraux (HIV, Hépatite C, CMV) échappement aux anticorps monoclonaux anti SARS CoV2) 
• De participer à la surveillance épidémiologique nationale (ex : résistance VIH, variants SARS CoV2, grippe…)

Tous les praticiens hospitaliers du service sont impliqués à des degrés variables selon leur statut universitaire ou non dans l’enseignement universitaire de la virologie au sein des différents cycles des filières de médecine, pharmacie, maïeutique, masters (facultés de médecine, pharmacie, chimie-biologie). Le service participe également à des actions de formations continues en virologie. La responsabilité de la formation au sein du service est coordonnée par le Pr R. Germi.

Le service de virologie est affilié à une unité de recherche de l’université Grenoble Alpes : l’Institut de Biologie Structurale (IBS) au sein d’un groupe de recherche dirigé par le Pr P. Poignard et le groupe « CAID » (Complément, Anticorps et Pathologies Infectieuses (https://www.ibs.fr/recherche/groupes-de-recherche/groupe-complement-anticorps-maladies-infectieuses-p-poignard/). Le principal axe de recherche du service consiste dans la découverte et la caractérisation d’anticorps neutralisants contre le VIH-1, le BK virus et d’autres agents infectieux en collaboration avec plusieurs laboratoires internationaux. Il existe également une recherche plus clinique (épidémiologie, outils diagnostiques, caractérisation de l’histoire naturelle, résistances aux antiviraux) concernant principalement le virus d’Epstein-Barr (Mononucléose Infectieuse, cancers associés à l’EBV, cycle lytique) et d’autres Herpesvirus, le VIH et les hépatites chroniques.